據(jù)統(tǒng)計(jì)約30%細(xì)胞系被交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí)，只因使用了交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí)的細(xì)胞而導(dǎo)致研究結(jié)論錯(cuò)誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細(xì)胞治療災(zāi)難性后果……，這將浪費(fèi)大量時(shí)間、精力和金錢。
為什么要進(jìn)行細(xì)胞系鑒定？
進(jìn)行細(xì)胞系STR鑒定是很重要的。很多生物醫(yī)藥的研究都采用培養(yǎng)細(xì)胞來(lái)進(jìn)行，這些細(xì)胞可能是受贈(zèng)于其它研究人員,也可能是從細(xì)胞庫(kù)(如美國(guó)?ATCC,American?Type?Culture?Collection)得來(lái)。據(jù)估計(jì)，15-20%的實(shí)驗(yàn)室，實(shí)驗(yàn)中所使用的細(xì)胞已經(jīng)不是原來(lái)的細(xì)胞系，或者與其它細(xì)胞系發(fā)生了交叉污染。顯然，細(xì)胞系遭到污染、特征鑒別錯(cuò)誤，將會(huì)極大的威脅著基于這些細(xì)胞而發(fā)表的論文質(zhì)量和研究發(fā)現(xiàn)的正確性。
如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細(xì)胞系身份?
收到細(xì)胞系鑒定結(jié)果以及 STR 信息，可以與參考數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。如果細(xì)胞樣本的每個(gè) STR 位點(diǎn)和參考細(xì)胞 STR 位點(diǎn)都能重合匹配，即說明該細(xì)胞系正確，反之則說明你的細(xì)胞系可能被錯(cuò)誤標(biāo)記，交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說來(lái)，匹配度≥80%即可認(rèn)為該細(xì)胞系正確，匹配度＜80%則說明該細(xì)胞系的來(lái)源需要被懷疑。
如果細(xì)胞系被鑒定出發(fā)生交叉污染或錯(cuò)誤標(biāo)記，則需要拿更早代數(shù)的細(xì)胞進(jìn)行鑒定，從而找到問題的起源或者直接從可靠的機(jī)構(gòu)購(gòu)買一株新的細(xì)胞系。
生物細(xì)胞STR鑒定服務(wù)
STR（Short Tandem Repeat，短串聯(lián)重復(fù)序列）基因分型已被ICLAC、ATCC等機(jī)構(gòu)作為鑒別細(xì)胞身份及交叉污染的金標(biāo)準(zhǔn)。海星生物對(duì)人源細(xì)胞21個(gè)STR位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè)，可方便與數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，具有較高的準(zhǔn)確性。
STR基因位點(diǎn)由長(zhǎng)度為3～7個(gè)堿基對(duì)的短串連重復(fù)序列組成， 這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中，可作為高度多態(tài)性標(biāo)記，被稱為細(xì)胞的DNA指紋。STR 基因座位上的等位基因可通過擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來(lái)區(qū)分，在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測(cè)來(lái)識(shí)別。隨后通過一定的計(jì)算方法，即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。
| 海星生物細(xì)胞系鑒定位點(diǎn)
| 細(xì)胞系鑒定服務(wù)流程
蘇州阿爾法生物提供 CRISPR/Cas9細(xì)胞基因編輯、載體構(gòu)建/病毒包裝、分子診斷標(biāo)準(zhǔn)品/突變基因標(biāo)準(zhǔn)品/融合基因標(biāo)準(zhǔn)品、細(xì)胞穩(wěn)轉(zhuǎn) / 細(xì)胞干擾等服務(wù)，還提供干細(xì)胞/原代細(xì)胞/細(xì)胞株、三系誘導(dǎo)培養(yǎng)試劑、ClonePlus™ 專用培養(yǎng)基、基因編輯試劑盒、病毒現(xiàn)貨、細(xì)胞專用血清等細(xì)胞相關(guān)試劑。
